Actualizado el 8 de julio de 2026

Software de facturación para tiendas online (ecommerce) que cumple Verifactu

Si vendes por internet, el problema no es facturar: es que cada pedido genere su factura o ticket solo, sin que tú copies datos entre tu tienda y tu programa. Con volumen, hacerlo a mano es inviable. Aquí va lo que de verdad integra con Shopify, WooCommerce y compañía —verificado en cada herramienta, no copiado de su folleto.

Qué tiene que hacer bien un programa para ecommerce

  • Conectar con tu plataforma (Shopify, WooCommerce, PrestaShop) para crear la factura o el ticket de cada pedido automáticamente.
  • Conectar con tu pasarela de cobro (Stripe, PayPal): así casa el cobro con su factura sin que lo hagas tú.
  • Emitir facturas simplificadas (tickets) para las ventas a particulares, y factura completa cuando el cliente la pide.
  • Y, por supuesto, cumplir Verifactu (todas las de nuestra comparativa lo hacen).

Las que integran de verdad

ProgramaTienda onlinePasarela de cobroPara quién
Quipu Shopify, WooCommerce, PrestaShop (nativo) Stripe, PayPal Autónomo/pyme con tienda que quiere facturas e impuestos también bajo control
Holded Shopify y más (nativo) Stripe, PayPal Negocio con stock y equipo que quiere el ecommerce dentro de un ERP
Billin Shopify (nativo) Quien vende en Shopify y quiere facturar fácil y barato
FacturaDirecta Shopify, WooCommerce (vía Zapier) Quien no necesita integración nativa y ya usa Zapier

El resto del catálogo factura muy bien, pero no destaca en la conexión con tiendas online; si el ecommerce es tu día a día, céntrate en las de arriba.

¿Cuál me conviene?

Depende de qué más necesites: si además quieres impuestos bajo control, Quipu encaja; si gestionas stock y equipo, Holded; si buscas lo más simple y barato vendiendo en Shopify, Billin. Cuéntanos tu caso y te decimos cuál —y por qué esa y no la siguiente—.

Preguntas frecuentes

¿Integración nativa o vía Zapier?

La nativa (el programa habla directo con Shopify o WooCommerce) es más fiable y automática. Zapier funciona, pero añade una capa intermedia y a veces coste. Para volumen alto, mejor nativa.

¿Y si cobro con Stripe o PayPal?

Que el programa se conecte con tu pasarela permite conciliar el cobro y emitir su factura automáticamente. Quipu y Holded lo cubren; otras se quedan en la parte de tienda.

¿Cuándo me obliga Verifactu?

Autónomos, desde el 1 de julio de 2027; sociedades, desde el 1 de enero de 2027. Más detalle en la guía de Verifactu.

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